为进一步落实整改任务、压实整改责任，确保巡视反馈意见整改见效、落实到位，推动全面从严治党向纵深发展，学校党委先后召开多次会议，反复研究酝酿，制定出台了《关于省委第八巡视组巡视反馈意见的整改方案》（以下简称《整改方案》），扎实做好巡视工作的“后半篇文章”。
《整改方案》由“旗帜鲜明讲政治，切实增强巡视整改政治自觉”“巡视反馈问题和整改措施”“整改要求”“建章立制清单”四个主要方面构成。按照省委巡视办的要求，学校集中整改时间从2018年8月24日到10月23日。
《整改方案》针对巡视发现的关于贯彻落实中央、省委决策部署不到位方面的问题，党委领导下的校长负责制执行不到位方面的问题，关于意识形态工作责任制落实不力方面的问题，关于抓党建工作聚力不深基础薄弱方面的问题，关于干部选拔不规范教育宽松软方面的问题，关于推进全面从严治党聚焦不力严抓严管有差距方面的问题，关于贯彻中央八项规定精神、反“四风”不力方面的问题，关于制度建设滞后存在廉洁风险方面的问题，共提出了106项具体整改措施。《方案》最后提出了加强组织领导、分类实施压实责任、强化督查问责等保障措施。
《整改方案》指出，省委巡视全面对标检验了我校各级党组织和党员领导干部的“四个意识”，必须通过巡视整改强化“四个意识”，践行“两个坚决维护”。要以最坚决的态度、最迅速的行动、最有力的措施狠抓整改落实，做到“条条要整改、事事有回应、件件有落实”。要以巡视整改为突破口和着力点，认真落实中央关于全面从严治党的部署要求，既把具体问题整改到位，又从制度机制上找原因。按照督查落实一批、细化完善一批、研究制定一批的思路，加强制度建设。《整改方案》进一步指出，要把巡视整改作为推动学校发展的强劲动力，紧紧围绕习近平总书记对云南工作“一个跨越、三个定位、五个着力”的目标要求和云南全力打好“绿色能源、绿色食品、健康生活目的地”及“建设中国最美丽省份”的战略定位，认真落实陈豪书记对西南林业大学工作的重要指示精神，加快推进学校“双一流”建设和跨越式发展。
根据省委第八巡视组关于巡视西南林业大学党委的反馈意见，学校还制定了《关于意识形态工作责任制落实情况专项检查反馈意见的整改方案》《关于省委组织部选人用人巡视检查反馈意见的整改方案》两个专项整改方案。
学校已将《整改方案》下发至各单位，要求落实好巡视整改工作，确保各项任务落到实处，取得预期工作成效。